Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms