Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMG1Q96Q15 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms