Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms