Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD4Q96M96 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms