Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms