Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNF8Q96H20 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms