Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX11Q96FC9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX11Q96FC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX11Q96FC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms