Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHFRQ96EP1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHFRQ96EP1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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