Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD4Q96DM1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms