Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RCN3Q96D15 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms