Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms