Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFKQ969G6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms