Protein–RNA interactions for Protein: Q93050

ATP6V0A1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A1Q93050 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A1Q93050 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V0A1Q93050 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms