Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUP205Q92621 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP205Q92621 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms