Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms