Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC12Q8WUD4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms