Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MCOLN3Q8TDD5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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