Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCPH1Q8NEM0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms