Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF248Q8NDW4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF248Q8NDW4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF248Q8NDW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF248Q8NDW4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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