Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG8Q8ND04 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms