Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBS3

SLC4A11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A11Q8NBS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A11Q8NBS3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A11Q8NBS3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms