Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms