Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP11CQ8NB49 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms