Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PNLDC1Q8NA58 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms