Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC89Q8N998 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms