Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC155Q8N6L0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms