Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf62Q8N4C0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms