Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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CA13Q8N1Q1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA13Q8N1Q1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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