Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP2Q86UW6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP2Q86UW6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.56■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
N4BP2Q86UW6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP2Q86UW6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms