Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms