Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMC1Q7Z7K0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMC1Q7Z7K0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms