Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMC6Q7Z403 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms