Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APTXQ7Z2E3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms