Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms