Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP31Q70CQ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP31Q70CQ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP31Q70CQ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms