Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC149Q6ZUS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC149Q6ZUS6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms