Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms