Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VITQ6UXI7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VITQ6UXI7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms