Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCD3Q6STE5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCD3Q6STE5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms