Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK4Q6SA08 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK4Q6SA08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms