Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L2Q6R6M4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms