Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED9Q6R2W3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms