Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHBDF2Q6PJF5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms