Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms