Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF549Q6P9A3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms