Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NEPROQ6NW34 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms