Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms