Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms