Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYW3Q6IPR3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYW3Q6IPR3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms