Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CARMIL2Q6F5E8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL2Q6F5E8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL2Q6F5E8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms