Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF123Q5XPI4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF123Q5XPI4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms